Metodi basati sul rilevamento dell’acido desossiribonucleico

La PCR e la PCR in tempo reale sono le tecniche più utilizzate per la rilevazione del DNA. Entrambe sono utilizzate qualitativamente per identificare le sostanze allergeniche negli alimenti amplificando una parte specifica della sequenza di DNA della specie o dell'allergene codificante.

È controverso individuare gli allergeni alimentari attraverso la tecnologia di rilevamento del DNA, perché questi metodi non rilevano gli allergeni bersaglio ma i marcatori del DNA, e i marcatori del DNA possono non avere nulla a che fare con l'effettivo contenuto di allergeni nell'alimento.

Esempi di prodotti che possono causare questo problema sono il latte in polvere o le uova in polvere, che sono alimenti formulati con componenti ricchi di proteine.

Per il successo dell'analisi con queste tecniche, è necessario prendere in considerazione diversi fattori, come la presenza e la qualità dei composti interferenti nella preparazione del DNA, nonché la quantità di DNA nel campione.

I componenti del saggio per l'analisi PCR sono generalmente disponibili in commercio e facili da sviluppare, il che rappresenta un vantaggio rispetto alla tecnologia ELISA.

Inoltre, i test ELISA non sono disponibili per alcuni allergeni regolamentati dalla legge, come il sedano, e la tecnologia PCR è l'unica opzione per l'analisi e il rilevamento.

In alimenti come la salsa di pomodoro, dove c'è un ambiente acido, il DNA è molto instabile, il che rappresenta uno svantaggio per la rilevazione con tecniche PCR. In tali circostanze, è opportuno utilizzare, ove possibile, metodi di rilevamento basati sulla rilevazione di proteine o peptidi.

Un altro fattore che può causare risultati falsi positivi è la contaminazione incrociata che può verificarsi nei laboratori, attraverso il contatto della miscela PCR con piccole quantità di DNA bersaglio provenienti da analisi precedenti.